Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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Tnfrsf18O35714 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf18O35714 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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