Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms