Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccrl2O35457 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccrl2O35457 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccrl2O35457 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccrl2O35457 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms