Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf5O35445 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf5O35445 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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