Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xbp1O35426 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms