Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms