Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms