Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms