Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sypl1O09117 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms