Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra2O08842 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra2O08842 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms