Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms