Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer2J3QPU5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer2J3QPU5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms