Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkal1J3QPP8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkal1J3QPP8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms