Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shisa8J3QNX5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms