Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc180J3QNE4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc180J3QNE4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms