Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp616J3QN14 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Zfp616J3QN14 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Zfp616J3QN14 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp616J3QN14 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp616J3QN14 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp616J3QN14 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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