Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E030018B13RikJ3QMS9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms