Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6594J3QM43 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms