Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c3J3QJW5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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