Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms