Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21897J3KMP5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms