Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20830J3KML6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms