Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh19G5E8H9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms