Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms