Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r39G3UWE6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms