Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms