Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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