Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms