Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8247F6VRJ8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms