Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Zfp988F6VKC7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp988F6VKC7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp988F6VKC7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp988F6VKC7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp988F6VKC7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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