Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms