Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms