Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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