Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Usp31E9Q6Y8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp31E9Q6Y8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Usp31E9Q6Y8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp31E9Q6Y8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp31E9Q6Y8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp31E9Q6Y8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp31E9Q6Y8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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