Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85cE9Q6B2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85cE9Q6B2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms