Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ythdc1E9Q5K9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ythdc1E9Q5K9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms