Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms