Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip11E9Q512 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms