Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpfE9Q3P4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms