Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms