Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acbd4E9Q289 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms