Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc171E9Q1U1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Ccdc171E9Q1U1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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