Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5cE9Q1F5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms