Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms