Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3095E9Q058 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms