Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms