Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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