Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gcom1E9PZ54 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms