Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms