Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm5415E9PXF3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms